Implanté à partir de 2004 au Logis de la Chabotterie de Saint-Sulpice-le-Verdon en Vendée, l'ensemble pratiquait exclusivement la musique baroque vocale et instrumentale. Le terme « simphonie » était synonyme d'« ensemble instrumental » aux XII et XIIIe siècles et Marais fait référence au quartier de Paris homonyme, haut-lieu du baroque français à son époque[1].
En 2006, le label Musiques à la Chabotterie voit le jour, tiré du festival du même nom et l'ensemble en assurait la gestion depuis 2013[2].
L'ensemble avait entrepris d'enregistrer une intégrale de la musique de Jean-Baptiste Lully, publiée chez l'éditeur Accord.
En 2020, l'ensemble organise et participe au Festival Marais Baroque à l'Hôtel de Sully à Paris, avec le Centre des Monuments historiques[3].
Il a été dissous par son fondateur, Hugo Reyne, en septembre 2020[4], après trente-trois ans d'activité, plus de mille concerts et avoir enregistré une cinquante de disques[5].
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