Déçu par les difficultés et les échecs dans la poursuite des auteurs nationaux-socialistes, Bader démissionne de son poste de procureur général en 1951. Au lieu de cela, il suit un appel en tant que professeur d'histoire juridique à l'Université de Mayence. En 1953, il devient titulaire de la chaire d'histoire juridique suisse et allemande à l'Université de Zurich. Il y restera jusqu'à sa retraite en 1975. Ses recherches portent sur l'histoire juridique et l'histoire régionale, en particulier dans la région alémanique. Au total, Bader compte plus de 1100 publications sur le droit pénal, l'histoire juridique, constitutionnelle et étatique. Il est cofondateur et corédacteur en chef de la Juristenzeitung(de). À partir de 1952, il est chargé de la section littérature du département allemand de la Zeitschrift der Savigny-Stiftung für Rechtsgeschichte(de).
Der deutsche Südwesten in seiner territorialstaatlichen Entwicklung, Koehler, Stuttgart 1950, Thorbecke, 2. Aufl., Sigmaringen 1978, (ISBN978-3-7995-6028-3).
Studien zur Rechtsgeschichte des mittelalterlichen Dorfes, 3 Bände, Böhlau, Weimar 1957–1973,
Vol. 1: Das mittelalterliche Dorf als Friedens- und Rechtsbereich, Böhlau, 3. Aufl., Cologne, Vienne 1981, (ISBN978-3-412-06981-0);
Vol. 3: Rechtsformen und Schichten der Liegenschaftsnutzung im mittelalterlichen Dorf.Mit Ergänzungen und Nachträgen zu den Teilen 1 und 2 der Studien zur Rechtsgeschichte des mittelalterlichen Dorfes, Böhlau, Cologne, Vienne, Graz 1973, (ISBN978-3-205-07102-0).
zusammen mit Gerhard Dilcher(de): Deutsche Rechtsgeschichte.Land und Stadt, Bürger und Bauer im alten Europa, Springer, Berlin u. a. 1999, (ISBN978-3-642-63677-6).
Ein Oberamtmann der Landgrafschaft Heiligenberg im Zeitalter des Dreißigjährigen Krieges. In: Schriften des Vereins für Geschichte des Bodensees und seiner Umgebung, 84. Jg., 1966, p. 19–38 (Digitalisat).
Manngrab und Hofstatt. Dans: Schriften des Vereins für Geschichte des Bodensees und seiner Umgebung, 92. Jg., 1974, p. 131–168 (Digitalisat).
Bibliographie
Ferdinand Elsener(de), Wilhelm Heinrich Ruoff(de) (dir.): Festschrift für Karl Siegfried Bader.Rechtsgeschichte, Rechtssprache, Rechtsarchäologie, rechtliche Volkskunde. Schulthess, Zürich 1965.
Walter Müller, Claudio Soliva(de) (dir.): Zwei Jahrzehnte Rechtsgeschichte an der Universität Zürich.Die Betreuung des Faches zur Zeit des Zürcher Ordinariats von Karl S. Bader (1953–1975). Schulthess, Zürich 1975, (ISBN3-7255-1664-2).