Jonah Lehrer est l'auteur de trois livres : Proust Was a Neuroscientist (2007), How We Decide (2009) et Imagine: how creativity works (2012).
Dans son premier livre, Proust Was a Neuroscientist, Lehrer prône une relation intime entre la science et les lettres. Il affirme notamment que plusieurs découvertes des neurosciences sont en fait des redécouvertes de travaux déjà effectués par divers artistes, dont Marcel Proust.
Dans How We Decide, Lehrer affirme que la prise de décision est influencée par deux principales parties du cerveau, la rationnelle et l'émotionnelle.
Imagine, publié en , a connu un certain succès (200 000 exemplaires vendus en 4 mois) jusqu'à ce que l'auteur ait avoué en avoir menti et inventé des citations de Bob Dylan. La diffusion de l'ouvrage a été immédiatement stoppée par son éditeur[6].