En 1946 il devient directeur du laboratoire d'astrophysique et de météorologie physique de l'université Johns-Hopkins. Durant cette période il développe l'astronomie embarquée sur ballon pour l'Office of Naval Research et, grâce à une expérience embarquée, montre la présence de vapeur d'eau dans l'atmosphère de Vénus.
En 1967 Strong rejoint l'université du Massachusetts à Amherst comme professeur de physique et d'astronomie, dirigeant le laboratoire d'astrophysique et de météorologie physique. Il prend sa retraite en 1981.