John Betsch est né à Jacksonville, (Floride) dans une famille musicale. Sa mère est organiste et pianiste dans une église et sa sœur aînée deviendra soprano lyrique. Il commence la batterie à l'âge de neuf ans, et débute professionnellement en 1963 à Nashville, aux côtés de l'organiste Bob Holmes et du trompettiste Louis Smith. De 1965 à 1967, il étudie à la Berklee School of Music de Boston, Massachusetts, puis à l'Université du Massachusetts à Amherst, sous la direction d'Archie Shepp et de Max Roach. John Betsch devient ensuite à son tour enseignant à l'Université d'Amherst, et prend part à des programmes éducatifs pour les détenus des prisons de ce même État. En 1974, il se produit au Newport Jazz Festival aux côtés de Max Roach.