Né à Copenhague le , Carl Joachim Andersen apprend la flûte, en même temps que son jeune frère Viggo, auprès de son père, le flûtisteChristian Joachim Andersen. Encore enfant il joue avec succès au théâtre du Casino accompagné par le jeune harpisteFrantz Pønitz. Dès l'âge de treize ans et jusqu'en 1868, il est première flûte dans l'orchestre de Niels Gade à Copenhague.
En 1882 il fonde l'Orchestre Philharmonique de Berlin avec Ludwig von Brenner[1] et cinquante-deux autres musiciens dissidents de l'orchestre de Bilse. Tout en continuant son métier de flûtiste, il commence à diriger. Il est notamment durant huit saisons le chef de l'un des deux concerts d'été quotidiens à Scheveningen.
Malade de la syphilis, en 1893 il est contraint de quitter son emploi à cause d'une paralysie de la langue et retourne à Copenhague où il travaille comme compositeur. Il compose notamment, parmi de nombreuses autres pièces, la musique des concerts pour les Jardins de Tivoli. Il fonde en 1897 une école d'orchestre qu'il dirige et où il est professeur de direction jusqu'à sa mort. En 1905 il est décoré par le roi Christian IX du Danemark de l'Ordre de Dannebrog. Il meurt le à Bagsværd
À la fois comme virtuose et compositeur pour la flûte il est considéré comme l'un des meilleurs de son temps. Il fut un chef solide et son exigence lui permit d'atteindre avec ses orchestres un niveau élevé. Son style lui valut d'être surnommé « le Chopin de la flûte »[1].
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Ses compositions sont presque exclusivement consacrées à la flûte. Les huit volumes de ses études sont considérées comme sa plus grande réussite et sont toujours utilisées par les élèves des classes de haut niveau professionnel.
Son œuvre complète est constituée de 67 numéros d'opus, principalement pour la flûte solo ou avec accompagnement au piano. La Marche en l'honneur de Christian X composée pour le couronnement du prince est sa pièce la plus populaire.
Pièces sous numéro d'opus
op.2 - Hungarian Fantasie (Ungarsk fantasi)
op.3 - Concert piece (Koncertstykke)
op.5 - Ballade and dance of the sylphs (Ballade et danse des Sylphes)
op.6 - Salon Piece (Morceaux de Salon)
op.7 - Impromptu
op.8 - Moto perpetuo
op.9 - At the river shore (Au Bord de la Mer)
op.10 - Tarantella
op.15 - Etudes for flute (Fløjteetuder)
op.16 - Characteristic Fantasy (Fantaisie Caractéristique)
op.19 - Album sheet (Album-Blatt)
op.21 - Etudes for flute (Fløjteetuder)
op.22 - The resignation and polonaise (La Résignation et Polonaise)
op.24 - Six salon pieces in two suites (Six Morceaux de Salon, en deux Suites)
op.26 - Variations Drolatiques
op.27 - Elegy variations (Variations Élégiaques)
op.28 - Two pieces (Deux Morceaux)
op.30 - Etudes for flute (Fløjteetuder)
op.33 - Etudes for flute (Fløjteetuder)
op.35 - Wien Neerlands Bloed
op.37 - Etudes for flute (Fløjteetuder)
op.41 - Etudes for flute (Fløjteetuder)
op.44 - L'Hirondelle
op.45 - Opera transcriptions (Operatranskriptioner)
op.46 - Reunion (Wiedersehen)
op.47 - Solo performance for young flutists (Solovortrag für junge Flötenspieler)
op.48 - Allegro Militaire
op.49 - Devils Polka (Pirun Polska)
op.50 - 6 Swedish polkas (6 Svenske polsker)
op.51 - Four salon pieces (Quatre Morceaux de Salon)
op.52 - Salon pieces, part 1 + 2 (Salonstücke Heft 1 + 2)