Jean Ier de Deux-Ponts ( - † à Germersheim, Palatinat du Rhin) est duc-palatin de Deux-Ponts de 1569 à sa mort, il est également le généalogiste de sa maison.
Son frère aîné Philippe Louis de Neubourg reçoit la principauté de Neubourg, Jean reçoit celle de Deux-Ponts. Héritant d'une principauté endettée, Jean rejoint Deux-Ponts en 1575. En 1578, il bascule du Luthéranisme à la confession Calviniste, ce qui le met en opposition avec ses frères. Durant toute sa vie, Jean souffre d'un handicap qui le fait boiter.
La tombe de Jean dans l'église Saint-Alexandre de Deux-Ponts a été détruite durant la Seconde Guerre mondiale.