Après ses études parisiennes de 1964 à 1968, il étudie la musicologie avec Yves Gérard et l'esthétique musicale avec Vladimir Jankélévitch à la Sorbonne jusqu'en 1970, parallèlement à une formation à l'École Nationale Supérieure des Bibliothèques[1].
Il collabore au Répertoire international de littérature musicale (RILM) de 1972 à 1985 et à la Revue de musicologie (1979–1982). En 1980, il crée la collection « Harmoniques » chez Flammarion, dont il devient le directeur[1]. Il est aussi producteur de nombreuses émissions pour France-Musique et à la Radio suisse romande.
Jean-Michel Nectoux centre ses recherches sur la musique française, mais aussi la littérature et les arts en général, de la période 1850 à 1925, étudiant plus particulièrement Proust, Mallarmé, Fauré, Debussy, Ravel, les Ballets russes et Igor Stravinsky[1]. Il est considéré comme une autorité sur Fauré, sujet de sa thèse de doctorat en 1980[1].
Jean-Michel Nectoux et Yves Gérard, L'Après-midi d'un faune : Mallarmé, Debussy, Nijinsky, Paris, Éditions de la Réunion des musées nationaux, coll. « Dossiers du Musée d'Orsay » (no 29), , 64 p. (ISBN2711822486, OCLC20690141, BNF35021541)
Catalogue de l'exposition présentée au musée d'Orsay du 14 février au 21 mai 1989.
Jean-Michel Nectoux, L'Opéra de Monte-Carlo : au temps du prince Albert Ier de Monaco, Paris, Ministère de la culture/Réunion des musées nationaux, coll. « Dossiers du Musée d'Orsay » (no 38), , 72 p. (ISBN2711823210, OCLC27186165)
Jean-Michel Nectoux et Danièle Gutmann, Gustav Mahler : un homme, une œuvre, une époque, Paris, Bibliothèque nationale, , 223 p. (ISBN2905296003, OCLC13269562)
Catalogue de l'exposition du Musée d'art moderne de la ville de Paris, du 24 janvier au 31 mars 1985
Articles
Jean-Michel Nectoux, « Debussy entre Michel-Ange et Degas », Musica e arti figurative / a cura di Mario Ruffini, , p. 213–223 (ISBN88-317-9517-1, OCLC887371063)
Jean-Michel Nectoux, « Voix, style, vocalité : les premiers interprètes de Fauré », D'un opéra l'autre, ?, p. 133–140 (OCLC610901646)
Jean-Michel Nectoux, « Réflexions sur la mélodie avec orchestre : Duparc, Debussy, Fauré et quelques autres », "L'esprit français" und die Musik Europas, ?, p. 692–700 (OCLC605654126)
Jean-Michel Nectoux et Stijn Alsteens, « Le faune et les sylphides : à propos d'un manuscrit inédit d'Ernest Ansermet sur Nijinski », La note bleue, ?, p. 329–366 (OCLC605610704)
Jean-Michel Nectoux, « Chopin ou le temps retrouvé », Frédéric Chopin: interprétations, ?, p. 173–192 (OCLC605366715)
Jean-Michel Nectoux et Jean-Jacques Eigeldinger, « Édouard Ganche et sa collection Chopin », Revue de la Bibliothèque nationale, no 7, (OCLC461947182)
Éditeur
Jean-Michel Nectoux (éd.), Camille Saint-Saëns et Gabriel Fauré, Correspondance : soixante ans d'amitié, Paris, Société française de musicologie / Heugel, , 133 p. (OCLC2980684)
Réédition Éditions Klincksieck, 1994.
Gabriel Fauré et Jean-Michel Nectoux (éd.), Correspondance, Paris, Flammarion, coll. « Harmoniques – Écrits de musiciens », , 363 p. (ISBN2080642596, OCLC7279293)
Jean-Michel Nectoux (éd.) (trad. Françoise Burgun et Marina Cheptiski), Serge Diaghilev : l'art, la musique et la danse : lettres, écrits, entretiens, Paris, Centre national de la danse / Institut national d'histoire de l'art / Vrin, coll. « Musicologies », , 539 p. (ISBN2914124465, OCLC862888418)
Gabriel Fauré, Correspondance suivie de Lettres à Madame H. : recueillies, présentées et annotées par Jean-Michel Nectoux, Paris, Fayard, , 914 p. (ISBN978-2-213-68708-7, BNF44438560)
(en) Jean Gribenski, The New Grove Dictionary of Music and Musicians (édité par Stanley Sadie) : Nectoux, Jean-Michel, Londres, Macmillan, seconde édition, 29 vols. 2001, 25000 p. (ISBN9780195170672, lire en ligne).