Fils du claveciniste Jacques Frisch, après des études de biologie, il est remarqué dès la fin de ses études musicales par des personnalités comme Pierre-Yves Artaud ou William Christie, et commence sa carrière avec Jean-Claude Malgoire. Au sein de La Grande Écurie et la Chambre du Roy, il participe à de nombreux concerts, disques, spectacles lyriques, tournées. Il développe parallèlement une activité de soliste et enregistre pour les labels Adda et Erato des CD consacrés à Gaspard Le Roux, Marin Marais et au jeune Mozart qui sont salués par la critique.
Il fait alors le choix de privilégier les projets personnels. Le succès de l'enregistrement de l'intégrale des sonates pour flûte de Vivaldi, le décide à créer XVIII-21 Musique des Lumières, l'ensemble avec lequel il pourra mettre en œuvre ses conceptions de la musique baroque. Depuis 2006, l'ensemble a pris le nom de XVIII-21, le baroque nomade.
Les premiers concerts de XVIII-21 ont été remarqués pour leur originalité aux festivals d'Ambronay, La Chaise-Dieu, et la recréation à Dijon de la version de chambre des Indes galantes de Rameau a fait reconnaître Jean-Christophe Frisch dans le milieu professionnel et parmi ses pairs comme le représentant d'une nouvelle génération de spécialistes de la musique baroque.
Son objectif est de montrer par une interprétation surtout vivante et sincère, que les découvertes musicologiques les plus récentes, celles que les générations précédentes de spécialistes n'avaient pas intégrées, rendent cette musique encore plus proche de notre sensibilité du XXIe siècle. La pratique de l'improvisation, devenue habituelle pour les musiciens de XVIII-21, est un exemple de l'évolution qu'il impose.
XVIII-21 est également connu comme un ensemble disponible pour les recherches musicologiques les plus délicates : le festival de Saint-Florent-le-Vieil l'a choisi pour retrouver et interpréter la musique jouée en Chine à l'époque des missions jésuites. Ce travail a été couronné par des concerts à Pékin en 1997 et par la sortie de deux disques chez Astrée-Auvidis. Ces disques ont reçu de nombreuses distinctions de la critique musicale : « 10 » de Répertoire, « Choc » du Monde de la musique, « ffff » de Télérama, nomination aux Victoires de la musique.
Parmi les réalisations de XVIII-21, on a remarqué la recréation de la version de chambre de Castor et Pollux de Rameau, produite en 1997 par l'ARCAL : 55 représentations dans de nombreuses villes de France et en région parisienne ont permis de préparer l'enregistrement du disque également sorti chez Astrée-Auvidis. C'est aussi le début d'une longue collaboration avec la soprano Cyrille Gerstenhaber. Le spectacle a été repris en à la Fenice de Venise, à l'Opéra de Rome, au festival de Bologne.
Depuis, d'autres opéras ont été produits : l'Imprésario des Canaries, opéra-bouffe de Domenico Scarlatti et Domenico Sarri a été créé en France pour le festival de Dijon en , Narciso de Domenico Scarlatti pour le festival de Besançon 2002.
Jean-Christophe Frisch se produit également en tournée sur d'autres continents. On l'a entendu ces dernières années en Indonésie, Israël, Bolivie-Brésil, Chine, Cambodge, Maroc, Norvège, Afghanistan, Syrie...
Depuis 1999, son ensemble XVIII-21 "Musique des Lumières" (devenu "le Baroque Nomade") est subventionné par le Ministère de la Culture (DRAC Ile de France).
En 2010, Jean-Christophe Frisch crée le Balkan Baroque Band[1], orchestre composé de musiciens des pays balkaniques (Croatie, Bulgarie, République tchèque, Grèce, Roumanie).
Discographie
Le Roux : Concerts à deux et basse continue, ensemble Variations (Adda/Accord 1990)
Mozart : Six sonates pour clavecin, avec accompagnement (violon ou flûte) et violoncelle, opus 3, K 10 à K 15 - Olivier Baumont, Antoine Ladrette (Adda 1991)
Vivaldi, Sonates pour flûte traversière, RV. 48–53 et RV. 58, (Musidisc, 1991)
Rameau : Les Indes Galantes, version de chambre (2CD Euromuses/Media7, 1994)
Rameau, Castor et Pollux, version de chambre (2CD Auvidis-Naïve, 1998)