De 1645 à 1650 il effectue un grand Tour dans les pays d'Europe dont l'Angleterre et la France. Il est accompagné de son frère, Auguste, qui est son cadet d'un an. En 1671 il hérite du duché à la mort de son père. Le il est décoré de Ordre de l'Éléphant, la plus haute décoration danoise dans il devient le 124e membre.
En 1684, il est à l'origine du premier pavillon de chasse bâti à Traventhal qui est suivi en 1685 par l'église Saint-Jean de Plön et en 1690 de l'église paroissiale de Plön. Jean Adolphe prend part à plusieurs des plus importants conflits militaires de son époque dont la guerre contre Empire ottoman et il laisse le gouvernement du duché pendant ce temps à s amère puis à son épouse. Pendant son règne la Paix de Travendal est une étape de la Grande Guerre du Nord signée dans son pavillon de chasse. En 1704 il se trouve en Hongrie et combat les Kurucs avec les forces d'Holstein-Plön et du Danemark et où il participe à la bataille de Smolenice.
Le duc Jean-Adolphe meurt le à Ruhleben, quelques jours après son fils, Adolphe-Auguste, se soit tué dans un accident de cheval. Comme Léopold-Auguste, le fils d'Adolphe-Auguste et petit fils de Jean-Adolphe meurt en enfance en 1706, son État revient au neveu de Jean-Adolphe, Joachim-Frédéric de Schleswig-Holstein-Plön, issu de la lignée de Schleswig-Holstein-Sonderbourg-Norbourg.
Adolphe-Auguste (né le ; mort le ), qui épouse Élisabeth-Sophie de Schleswig-Holstein-Sonderbourg-Nordborg (1683-1767) : Parents du duc Léopold-Auguste