Il évolue avec Randwick et les NSW Waratahs. De parents d'origine galloise, même s'il joue avec les Barbarians australiens et fait une tournée en Argentine avec les Wallabies, il n'obtient pas de sélection officielle. C'est pourquoi, il quitte l'Australie rejoint le pays de Galles où il dispute son premier test match avec l'équipe du pays de Galles le contre l'Argentine. Son dernier match international a lieu dans le cadre du Tournoi des Six Nations le contre la France. Jason Jones-Hughes participe à la coupe du monde 1999 (2 matchs).
Il évolue en club avec le Newport RFC de 1999 à 2003, faisant 51 apparitions et inscrivant 14 essais[1], puis rejoint le Munster. Il arrête sa carrière à la suite de nombreuses blessures ou maladies.