Ismael Lejarreta est issue d'une famille de cycliste. Il grandit dans sa ville natale de Bérriz, au Pays basque, vers le mont Oiz. Ses deux frères Marino (né en 1957) et Néstor, furent également coureurs professionnels.
Son fils Iñaki, mort le percuté par un automobiliste[1], est également coureur de VTT et a été champion du monde VTT junior en 2001 et champion d'Espagne en 2007.