Isabelle-Antoinette de Croÿ est le second enfant et la fille unique de Charles Alfred 12e duc de Croÿ (1859-1906), chef de sa maison, et de son épouse Ludmilla princesse et duchesse d'Arenberg (1870-1953), fille d'Engelbert-Auguste d'Arenberg[1].
Isabelle-Antoinette a trois frères : 1) Karl-Rudolph 13e duc de Croÿ (1889-1974), 2) Engelbert (1891-1974) et 3) Anton (1893-1973).
Nicolas Énache, La descendance de Marie-Thérèse de Habsburg, Paris, Éditions L'intermédiaire des chercheurs et curieux, , 795 p. (ISBN978-2-908003-04-8).