En 1548, son père, Nobumasa, trahit Hosokawa Harumoto mais il est vaincu et contraint au suicide, raison pour laquelle Nagamasa lui succède à la tête de la maison. Il dirige toute la province de Settsu pendant un certain temps puis devient un des obligés de Miyoshi Nagayoshi après que celui-ci l'a défait au combat.