En 1800, le premier Préfet de la Meurthe, Jean-Joseph Marquis, fut logé dans l'hôtel Alliot, sur la place Royale (actuellement place Stanislas). La préfecture est ensuite hébergée dans l'ancien palais de l'Intendance avant d'investir en 1858 l'hôtel Baligand (du nom de l’ingénieur et inspecteur des bâtiments Jean-Jacques Baligand (1697-1762), construit entre 1756 et 1764).
Le bâtiment d'angle, dit "Petite Préfecture" y est adjoint et l'Hôtel est alors agrandi par l'architecte Corrard des Essarts, qui lui ajoute son aile latérale Sud dans laquelle est aménagée une grande salle des Fêtes[1]. Les bureaux sont installés dans les bâtiments adjacents à l'ancien Hôtel particulier.
Incendié en 1896, et partiellement détruit en 1941-43, l'hôtel de la Préfecture est complètement restructuré par l'architecte Georges Vallin.