En 1543, Ujitsuna lève ses armées pour venger de Takakuni qui a été tué par Hosokawa Harumoto. Il est dans un premier temps dans une situation désavantageuse; Cependant, Miyoshi Nagayoshi, le vassal de Harumoto, trahit Harumoto et se range du côté d'Ujitsuna. En 1549, enfin, Ujitsuna est en mesure de chasser Harumoto de la province d'Ōmi.
En 1552, Ujitsuna engage ses armées avec Nagayoshi puis est nommé kanrei. Cependant, en tant que créature de Nagayoshi, Ujitsuna n'a aucun pouvoir réel. Après cela, Ujitsuna reçoit le château de Yodo dans la province de Settsu et est aidé par Nagayoshi.
