Herman Philipse a écrit de nombreux ouvrages philosophiques en néerlandais, y compris des livres sur la logique de Husserl, le rôle de la certitude dans la théorie morale de Descartes et un Atheïstisch manifest (Manifeste athée) largement diffusé (1995, 2004)[1],[2]. En anglais, il a écrit plus d'une douzaine d'articles dans des revues philosophiques, ainsi qu'une évaluation détaillée de Martin Heidegger, La philosophie de l'être de Heidegger: une interprétation critique. Il a également écrit de nombreux commentaires pour des journaux néerlandais (le plus souvent en tant que contributeur régulier au NRC Handelsblad) et des programmes télévisés d'actualité, défendant l'athéisme et préconisant l'assimilation culturelle des immigrants non européens aux Pays-Bas.
Herman Philipse, Heidegger's Philosophy of Being : A Critical Interpretation, Princeton University Press, , 555 p. (ISBN978-0-691-00119-7, lire en ligne)
Herman Philipse, Acht Filosofische Miniaturen : Een hoorcollege over grote denkers van Plato tot Wittgenstein, Home Academy Publishers (audio-cd), (ISBN978-90-8530-003-8)
Herman Philipse, Filosofen van de 20e eeuw : Een hoorcollege over acht moderne denkers, Home Academy Publishers (audio-cd), (ISBN978-90-8530-014-4)
Herman Philipse, Godsdienstfilosofie : Een hoorcollege over religie tussen wonder en wetenschap, Home Academy Publishers (audio-cd), (ISBN978-90-8530-050-2)
Herman Philipse, Wetenschap versus godsdienst : Een hoorcollege over grote conflicten, van Copernicus tot Dawkins, Home Academy Publishers (audio-cd), (ISBN978-90-8530-203-2)
Herman Philipse, Ethiek en Evolutie : Een hoorcollege over de geschiedenis, biologie, filosofie en antropologie van de moraal, Home Academy Publishers (audio-cd), (ISBN978-90-8530-403-6)
Herman Philipse, Godsgeloof of atheïsme? Een hoorcollege over de filosofische strijd der wereldbeschouwingen, Home Academy Publishers (audio-cd), (ISBN978-90-8530-056-4)
Herman Philipse, Filosofische polemieken, Uitgeverij Bert Bakker, (ISBN978-90-351-3502-4)
Herman Philipse, Betrouwbare kennis : Een hoorcollege over wetenschapsfilosofie in historisch perspectief, Home Academy Publishers (audio-cd), (ISBN978-90-8530-930-7)
Herman Philipse, Vrijheid en verplichting : Een hoorcollege over wijsgerige ethiek, van Plato tot Levinas, Home Academy Publishers (audio-cd), (ISBN978-90-8530-100-4)