À la suite de la sécession de l'Alabama de l'Union, Clayton mène ses hommes à Pensacola, Floride, pour s’enrôler dans le service des nouveaux États confédérés d'Amérique en . Leur service n'est pas initialement requis, mais Clayton reçoit par la suite l'ordre de prendre le commandement de toutes les troupes de volontaires de l'Alabama alors qu'elles se rassemblent à Pensacola. Le 1st Alabama Infantry entre formellement au service de la Confédération fin mars, avec Clayton étant le premier colonel. Le régiment combat pendant deux jours, où le 1st Alabama se comporte remarquablement lors de la bataille de la baie de port Barrancas.
En , Clayton démissionne et retourne en Alabama. Là, le gouverneur l'autorise à lever un nouveau régiment pour le service de la Confédération, le 39th Alabama. Clayton est nommé en tant que colonel, et le régiment rejoint la brigade du brigadier généralFranklin Gardner. La première campagne significative de Clayton se déroule avec l'armée de Braxton Bragg lors de la campagne du Kentucky de 1862.
Le régiment de Clayton combat lors de la bataille de Stones River au début de l'hiver faisant partie de la brigade du brigadier général Zachariah Deas(en). Clayton subit une blessure sévère, mais recouvre la santé et est promu brigadier général en . Il est affecté au commandement de la brigade précédemment commandée par Alexander P. Stewart comprenant les régiments 18th, 32nd, 36th, 38th, et 58th Alabama. Clayton est actif lors des campagnes et batailles qui suivent, dont Chickamauga et Chattanooga. Sa brigade joue un rôle important pendant les combats de la campagne d'Atlanta de 1864. À la suite de la bataille de New Hope Church, Clayton est promu major général et affecté au commandement de la division de Stewart de l'armée du Tennessee, où il participe à la campagne de Franklin-Nashville qui se solde par un échec.
Avec la chute de la Confédération, Clayton reprend l'exercice du droit. En , il est élu juge « circuit court ». Comme beaucoup d'anciens confédérés, il est déchu de son poste par le gouvernement de la Reconstruction. Néanmoins, il est réélu deux fois en tant que juge en 1874 et 1880 après que les carpetbaggers ont quitté le pouvoir.
En 1886, Clayton accepte de devenir le président de l'Université de l'Alabama, un poste qu'il tient jusqu'à sa mort à Tuscaloosa, Alabama, à l'automne 1889. Il est enterré à Eufaula.
Références
↑'History of Alabama and Dictionary of Alaba Biography', Thomas McAdory Owen and Marie Bankhead Owen, S.J.Cements Publishing:1921, pg. 347
Une biographie complète de Henry Clayton a été écrite par Henry Walker lors d'un thèse de doctorat pour l'université de l'Alabama, 1995.
Liens externes
Photo gallery at the Wayback Machine (archived February 8, 2008)
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