Il est sélectionné à 18 reprises en équipe d'Autriche A et prend part à la phase finale de la Coupe du monde 1958 puis atteint les quarts de finale de la première édition du championnat d'Europe.
Carrière d'entraîneur
Helmut Senekowitsch devient entraîneur en 1971 et cette nouvelle carrière le mène en Autriche, au Mexique, en Grèce, en Espagne et en Allemagne. Il devient également durant deux saisons (1976-1978) le sélectionneur de l'équipe d'Autriche A, qu'il mène en phase finale de la Coupe du monde en Argentine.