Plus tard, il participe à de nombreux enregistrements avec George Russell et Jimmy Giuffre. Il enregistre également ses propres albums, dont Triple Exposure en 1957, pour Prestige.
Un bon exemple de solo de McKusick peut être entendu sur All About Rosie, le titre-phare de la suite pour orchestre, avec Bill Evans (écrite par George Russell et dirigée par Gunther Schuller), enregistrée en live au Brandeis Jazz Festival en 1957.
En 1958, McKusick dirige un petit ensemble avec Bill Evans, avec lequel il enregistre Cross Section Saxes, sur lequel figurent également Art Farmer, Paul Chambers et Connie Kay, sur des morceaux de Giuffre. Il collabore également avec d'autres grands musiciens de jazz comme Lee Konitz ou John Coltrane.