Filip Derkoski commence la natation à l'âge de 6 ans, poussé par ses parents, au sein du club SWC Orion de Skopje[1].
Il participe aux Jeux olympiques de Tokyo en 2021, sur le 400 mètres nage libre. S'il ne parvient pas à se qualifier pour la finale, il bat néanmoins son record personnel de 76 centièmes, ce qui lui rapporte 739 points dans le classement FINA. Il s'agit du meilleur résultat jamais atteint pour un nageur macédonien[2].
