Filip Derkoski débute la natation à l’âge de six ans, encouragé par ses parents, au sein du club SWC Orion à Skopje, sous la supervision de l'entraineur Jane Karajovanov[1].
Il participe aux Jeux olympiques de Tokyo en 2021, sur le 400 mètres nage libre. Bien qu’il ne parvienne pas à se qualifier pour la finale, il établit un nouveau record personnel avec un chrono de 4 min 3 s 34, améliorant son précédent temps de 76 centièmes. Cette performance lui rapporte 739 points au classement World Aquatics, constituant alors le meilleur résultat jamais atteint pour un nageur macédonien[2].
