1 Compétitions officielles nationales et internationales senior, incluant le parcours amateur et en équipe réserve. 2 Matchs officiels. Dernière mise à jour :
À son retour à Porto, pour la saison 2008-2009, Fernando se fait une place aux côtés de Lucho González et Raul Meireles dans le onze de départ alors que le club s'offre un quatrième titre de champions du Portugal d'affilée. Lors de la saison 2010-2011, il continue de s'afficher en tant que titulaire indiscutable, apparaissant dans 41 rencontres officielles alors que son club réalise le triplé Primeira Liga, Taça de Portugal et Ligue Europa.
Le 9 février 2014, alors qu'il ne lui restait que 6 mois de contrat, il prolonge avec le FC Porto jusqu'en 2017[4].
Manchester City (2014-2017)
Le 25 juin 2014, Fernando signe à Manchester City pour un montant d'environ 15 millions d'euros[5]. En arrivant, Fernando a déclaré : "Je vais donner tout ce que j'ai à chaque fois que je jouerai et j'ai hâte de passer de nombreuses années à Manchester".
En janvier 2013, Fernando déclare : "Même si quelqu'un me demande de me naturaliser, je refuserais. Mon rêve est de jouer pour le Brésil. Je suis sûr qu'un jour je porterai le amarelinha[11]. Malgré cela, il prit la nationalité portugaise en décembre[12], demandant à la FIFA en mars 2014 de changer son allégeance internationale au Portugal[13]; selon l'article 8.1 régissant les statuts de l'organisme, malgré son changement de nationalité, il peut être sélectionné que pour le Brésil ayant déjà joué pour ce pays avec les moins de 20 ans alors qu'il ne possédait pas la nationalité portugaise[14],[15].