Emanuele Onesti commence le cyclisme à l'âge de six ans. Il joue également au basket-ball jusqu'à ses douze ans, avant de se consacrer uniquement au vélo[1]. En marge de sa carrière, il a mené des études à la faculté des sciences du sport de l'université de Chieti[2].
Bon sprinteur, il remporte de nombreuses courses dans les catégories de jeunes. Il intègre ensuite l'équipe espoirs de Vini Fantini Nippo en 2014[3]. Lors de l'année 2015, il termine notamment quatrième du Gran Premio della Liberazione chez les espoirs. Il effectue également un stage dans l'équipe professionnelle Nippo-Vini Fantini, sans toutefois obtenir de contrat professionnel. Les deux saisons suivantes, il se cantonne principalement au calendrier amateur italien, où il obtient trois victoires et diverses places d'honneur
