Stouffer entre à l'Université du Kansas en 1914 comme professeur adjoint, et en 1917 professeur agrégé et en 1921 professeur titulaire. En 1922, il devient également doyen de la Graduate School. En 1946-1951, il est doyen de l'Université pendant son programme d'expansion académique après la Seconde Guerre mondiale. Il prend sa retraite en tant que doyen en 1951 mais continue à enseigner jusqu'en 1955.
Il est marié a une fille[3]. Il est le directeur de thèse de Wealthy Babcock[4]. À l'Université du Kansas, la chaire de mathématiques EB Stouffer est créée en son honneur.
Stouffer, « Some canonical forms and associated canonical expressions in projective differential geometry », Bull. Amer. Math. Soc., vol. 34, no 3, , p. 290–302 (DOI10.1090/s0002-9904-1928-04556-1, MR1561552)
Avec Ernest P. Lane: Stouffer et Lane, « Recent developments in projective differential geometry », Bull. Amer. Math. Soc., vol. 34, no 4, , p. 453–472 (DOI10.1090/s0002-9904-1928-04563-9, MR1561588)