El Kabir Pene commence le basket-ball à Thiès au Sénégal. Il joue en senior avec l'équipe de Gorée. Il est ensuite repéré par le club de Clermont-Ferrand (Pro A - France) grâce auquel il fait ses premiers pas dans le championnat français. Il porte les couleurs clermontoises pendant deux saisons et fait des piges à Vichy. En 2008, il participe à la montée de l'ASM du Puy-en-Velay en Nationale 1. En 2009, Pene est le meneur de Feurs, Les enfants du Forez. Il acquiert cette année la nationalité français tout en conservant la sénégalaise. La saison suivante, il évolue à Mâcon puis à Rennes, depuis 2011.
Au-delà de sa carrière de joueur, il organise un camp de basket-ball en avec Malick Badiane pour les jeunes basketteur de Thiès. À la suite de cette action, il crée en une association YaThi'Breizh favorisant les échanges entre la Bretagne et Thiès et permettant d'acheminer divers équipements (éducatif, sportif, médical) au Sénégal. Un camp de basket-ball est organisé sur trois jours avec les 50 meilleurs élèves de Thiès suivi de la distribution des dons récoltés. L'association a aussi pour but de sensibiliser la jeune génération à l'écologie et l'environnement.
