De Dionysio Scytobrachione. Bonn 1880. (Dissertation)
Quaestiones Herodotae. Rostock 1890.
Fünf Vorträge über den griechischen Roman. Berlin 1896. 1943. Nachdruck Berlin/Boston 2018.
Zur Entstehung der Ilias. Strasbourg 1918.
Das Geschichtswerk des Thukydides. Bonn 1919. 2. Auflage 1929.
Kyrillos von Skythopolis (Texte und Untersuchungen zur Geschichte der altchristlichen Literatur 4. Reihe 4. Band 2. Heft = 49. Band 2. Heft) Leipzig 1939.
Charakterköpfe aus der Antike: Fünf Vorträge. Leipzig 1906. 2. Auflage 1943. 1948.
Gesammelte Schriften I–V. Berlin 1938–1963.
éditions critiques
Scholia in Euripidem, collegit, recensuit, edidit. 2 Bände. Berlin 1887
Eusebius Werke, 2. Bd., 1.–3. T.: Die Kirchengeschichte, herausgegeben von Eduard Schwartz (Die Griechischen Christlichen Schriftsteller der ersten drei Jahrhunderte; Band 9). Leipzig 1903–1909 / 2. unveränderte Auflage, hrsg. von Friedhelm Winkelmann(de), Berlin 1999:
Teil 1.: Bücher I–V, hrsg. von Eduard Schwartz; Die lateinische Übersetzung des Rufinus, bearbeitet im gleichen Auftrage von Theodor Mommsen. Leipzig 1903.
Teil 2.: Bücher VI–X, hrsg. von Eduard Schwartz; Die lateinische Übersetzung des Rufinus, bearbeitet im gleichen Auf. von T. M. (†); Über die Märtyrer in Palästina, hrsg. von Eduard Schwartz; Rufinus, Vorrede, Einlage über Gregorius Thaumaturgus, Buch X und XI, hrsg. von Theodor Mommsen (†). Leipzig 1905.
Teil 3.: Eduard Schwartz, Theodor Mommsen (†), Einleitungen, Übersichten und Register. Leipzig 1909.
Christliche und jüdische Ostertafeln ((Abhandlungen der Gesellschaft der Wissenschaften zu Göttingen, Philologisch-Historische Klasse; Neue Folge 8,6). Berlin 1905.
Acta conciliorum oecumenicorum. Berlin & Leipzig, 1914–1940.
Tomus 1: Concilium Universale Ephesenum (AD 431)
Tomus 2: Concilium Universale Chalcedonense (AD 451)
Tomus 3: Collectio Sabbaitica contra Acephalos et Origenistas destinata (AD 536)
Tomus 4: Concilium Universale Constantinopolitanum sub Iustiniano habitum (AD 553).
Codex Vaticanus Gr. 1431: Eine Antichalkedonische Sammlung aus der Zeit Kaiser Zenos, (Abhandlungen der Bayerischen Akademie der Wissenschaften. Philosophisch-philologische und historische Klasse; Band 32. Abhandlung 6) Munich 1927.
Albert Rehm: Eduard Schwartz’ wissenschaftliches Lebenswerk. In: Sitzungsberichte der Bayerischen Akademie der Wissenschaften, Philosophisch-Historische Abteilung. Jahrgang 1942, Heft 4 (mit Schriftenverzeichnis p. 67–75, 387 Nummern), Digitalisat.
Mischa Meier: „Ein dogmatischer Streit“ – Eduard Schwartz (1858–1940) und die ‚Reichskonzilien‘ in der Spätantike. In: Zeitschrift für antikes Christentum. Volume 15 (2011), p. 124–139
↑Ernst Klee: Das Kulturlexikon zum Dritten Reich. Wer war was vor und nach 1945. S. Fischer, Frankfurt am Main 2007, (ISBN978-3-10-039326-5), S. 558.
↑Albert Rehm, Eduard Schwartz' wissenschaftliches Lebenswerk (Sitzungsberichte der Bayerischen Akademie der Wissenschaften, Philosophisch-Historische Abteilung; 1942, 4). München 1942, 67–75.