Utsunomiya est dirigé par le clan Utsunomiya, l'un des huit grands groupes de samouraïs du nord de la région du Kantō et branche cadette du clan Fujiwara depuis l'époque de Kamakura. En reconnaissance de son soutien à Toyotomi Hideyoshi à la bataille d'Odawara de 1590, Utsunomiya Kunitsuna reçoit le statut de daimyo pour un revenu maximum de 187 613 koku. Cependant, en 1597, les Utsunomiya sont spoliés de leurs possessions lorsque les espions de Hideyoshi lui révèlent que leurs revenus réels sont plus du double que ce qui leur est autorisé. La zone est brièvement remise au clan Gamo d'Aizu mais, après la bataille de Sekigahara et la fondation du shogunat Tokugawa, Tokugawa Ieyasu se rend compte qu'elle est stratégiquement importante en raison de sa position à la jonction des routes Ōshū Kaidō et Nikkō Kaidō.
Le domaine d'Utsunomiya, d'une valeur de 100 000 koku, est créé pour Okudaira Iemasa, petit-fils de Tokugawa Ieyasu via sa fille aînée Kame-hime. Sa création est une surprise car Okudaira Iemasa a jusque-là été ignoré par Ieyasu et n'a pas de domaine ni même de vassaux pour le servir. Cependant, au moment de la campagne d'Osaka, Iemasa tombe malade et doit rester à l'arrière au château d'Edo où il meurt quelques jours plus tard. Son fils, Okudaira Tadamasa, devient le nouveau daimyo, à seulement 7 ans, et il est décidé que Utsunomiya a trop d'importance pour être laissé entre ses mains. Il reçoit une augmentation à 110 000 koku et est transféré au domaine de Koga dans la province de Shimosa.
Pour remplacer les Okudaira, le shogunat se tourne vers le clan Honda en qui il a confiance, transférant Honda Masazumi du domaine d'Oyama en 1617 et augmentant les revenus maximum d'Utsunomiya à 155 000 koku. Il reconstruit en grande partie le château d'Utsunomiya et la ville fortifiée autour, et accueille avec succès le shogun Tokugawa Hidetada dans son pèlerinage vers le sanctuaire Nikkō Tōshō-gū en 1622. Cependant, Hidetada contourne Utsunomiya sur son chemin de retour vers Edo, et Masazumi est démis de son poste et exilé au domaine de Kubota en résidence surveillée. La raison donnée par les officiels du shogun est qu'un complot a été découvert visant à assassiner Hidetada en utilisant une chambre piégée avec un plafond tombant. L’événement est appelé l'« incident du plafond suspendu du château d'Utsunomiya ».
Le domaine est ensuite retourné à Okudaira Tadamasa mais réduit à un revenu maximum de 110 000 koku. Tadamasa dirige Utsunomiya pendant quarante-six ans jusqu'à sa mort en 1668, accueillant l'entourage du shogun à plusieurs occasions. Cependant, à sa mort, l'un de ses plus anciens serviteurs, Sugiura Ezaemon, se suicide par junshi, ce qui a été interdit par le shogunat depuis cinq ans. De plus, seulement quelques jours après cet acte, un serviteur du domaine est impliqué dans le « duel entre Utsunomiya et le Kōzen-ji », alors que les duels sont également interdits. Le fils d'Oukdaira Tadamasa, Masayoshi, est réduit à un revenu maximum de 20 000 koku et transféré au domaine de Yamagata.
Utsunomiya est ensuite donné à Matsudaira Tadahiro, et le domaine est autorisé à un revenu maximum de 150 000 koku. Le père de Tadahiro est le frère utérin d'Okudaira Tadamasa. Il est transféré au domaine de Shirakawa dans la province de Mutsu treize ans plus tard en 1681.
Le domaine revient ensuite au clan Honda à Honda Tadahira, qui a échangé celui de Shirakawa avec Matsudaira Tadahiro. Cependant, il devient très impopulaire et connait des difficultés à assurer la collecte des taxes. Il est transféré au domaine de Kōriyama en 1685.
Le domaine est réduit à 90 000 koku, et le fils d'Okudaira Masayoshi, Okudaira Masaakira, est autorisé à revenir à Utsunomiya depuis Yamagata. Il se distingue en établissant un réseau médical à Utsunomiya avec vingt médecins chargé de soigner les voyageurs. Il meurt en 1695 à l'âge de 28 ans, et comme son fils, Masashige, n'a que deux ans, il est transféré au domaine de Fukuyama dans la province de Bungo.
Le domaine est ensuite donné à Abe Masakuni, ancien daimyo du domaine de Miyazu dans la province de Tango, qui dirige pendant treize ans jusqu'à son transfert au domaine de Fukuyama.
Le domaine est réduit à un revenu maximum de 70 000 koku et donné à Toda Tadazane, ancien daimyo du domaine de Takada dans la province d'Echigo. Il sert comme rōjū de Tokugawa Ietsugu et de Tokugawa Yoshimune. Son fils et son petit-fils règnent jusqu'à ce que le clan échange le fief avec le domaine de Shimabara de Matsudaira Tadamasa dans la province de Hizen en 1738. Sous les Matsudaira, Utsunomiya connait des inondations répétées et de faibles récoltes. Les dépenses pour l'échange de domaines avec Shimabara forcent les Matsudaira à augmenter les taxes, ce qui provoque des révoltes paysannes réprimées par la force. Pour ajouter à leurs problèmes, la ville d'Utsunomiya connait également plusieurs incendies qui provoquent de grands dégâts. Matsudaira Tadahiro est retransféré à Shimabara en 1774, échangeant de nouveau de domaines avec le clan Toda.
Toda Tadato est le quatrième fils de Toda Tadami, et comme avec les Matsudaira, l'échange de domaine avec celui de Shimabara mène à la faillite du clan, et le pèlerinage du shogun Tokugawa Ieharu au Nikkō Tōshō-gū en 1776 est fortement compliqué par cela. Néanmoins, le clan règne pendant sept générations jusqu'à la période du Bakumatsu.
Après l'abolition du système han de , le domaine d'Utsunomiya devient une partie de la préfecture de Tochigi.
Le domaine avait une population de 59 908 personnes réparties dans 15 557 foyers selon un recensement de 1870[2].
Possessions à la fin de l'époque d'Edo
Comme la plupart des domaines japonais, Utsunomiya est composé de plusieurs territoires discontinus dont la valeur kokudaka est fondée sur une estimation périodique du potentiel agricole[3],[4].
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