L'évêché est la ville de Bragance, où se trouve la cathédrale Notre-Dame-de-la-Reine. A Miranda do Douro se situe la co-cathédrale de Santa Maria.
Le territoire s'étend sur 6 599 km² et est divisé en 322 paroisses. A partir du 16 juin 2012, l'organisation territoriale du diocèse a été révisée, avec la réduction des archiprêtrés de 12 à 4 :
archiprêtré de Bragance, comprenant les communes de Bragance et Vinhais ;
archiprêtré de Miranda do Douro, comprenant les municipalités de Miranda do Douro, Mogadouro et Vimioso ;
l'archiprêtré de Mirandela, comprenant les communes de Mirandela et Macedo de Cavaleiros, et la paroisse de Castro Vicente dans la commune de Mogadouro ;
Le diocèse de Miranda a été érigé le 22 mai 1545 avec la bullePro excellenti Apostolicae Sedis du pape Paul III, obtenant son territoire de l'archidiocèse de Braga. Le nouveau diocèse était composé de 338 freguesias réparties en 5 archiprêtrés : Miranda do Douro, Bragance, Monforte, Mirandela et Lampaças[1].
En 1552, la construction de la cathédrale a commencé, elle est achevée vers la fin du siècle ; déjà en 1566, l'évêque António Pinheiro avait consacré le maître-autel.
Le 4 août 1607, l'évêque Diogo de Sousa établit le séminaire diocésain, dédié à saint Joseph.
Le 17 novembre 1764, l'évêque Aleixo de Miranda Henriques, en raison du déclin de la cité épiscopale, demande et obtient du roi Joseph Ier l'autorisation de transférer l'évêché à Bragance, transfert qui est mis en œuvre l'année suivante. En 1766, le séminaire diocésain a également déménagé à Bragance.
Le 10 juillet 1770, le diocèse de Miranda fut divisé en deux avec l'érection de celui de Bragance, en vertu du brefPastoris aeterni du pape Clément XIV ; l'ancienne église jésuite du Saint Nom de Jésus a été construite comme une cathédrale. Cependant, la séparation n'a duré que 10 ans. En effet, le 27 septembre 1780, les deux diocèses ont été réunis avec la bulle Romanus Pontifex du pape Pie VI et le siège du diocèse a été placé à Bragance.
En 1881, le diocèse s'agrandit en incorporant l'archidiaconé de Moncorvo, qui appartenait à l'archidiocèse de Braga. Le 20 avril 1922, cependant, il cède l'archiprêtré de Monforte au profit de l'érection du diocèse de Vila Real. À partir de ce moment, le territoire diocésain coïncide avec celui du district civil.