Le diocèse de Loja (en latin : Dioecesis Loiana ; en espagnol : Diócesis de Loja) est un diocèse de l'Église catholique en Équateursuffragant de l'archidiocèse de Cuenca.
Le diocèse de Loja est érigé le 29 décembre 1862 par le pape Pie IX en prenant sur le territoire du diocèse de Cuenca[1]. Les diocèses de Bolívar (aujourd'hui diocèse de Riobamba) et d'Ibarra sont créés le même jour mais en prenant sur le territoire de l'archidiocèse de Quito[2].
Le 26 juillet 1954, Loja cède une partie de son territoire pour l'établissement de la prélature territoriale d'El Oro (aujourd'hui diocèse de Machala). Nommé suffragant de l'archidiocèse de Quito lors de sa création[2], il intègre la province ecclésiastique de Cuenca le 9 avril 1957[3].