Alors qu'il joue pour les Ranchers Bees, cet attaquant puissant est sélectionné par Clemens Westerhof à la CAN de 1990. Repéré par le FC Bruges, il rejoint la Belgique. Ses bonnes performances lui assurent une place de titulaire à la Coupe du monde de 1994, lors de laquelle il marque deux buts. Le Nigeria atteint les huitièmes de finale pour sa première participation au tournoi.
Amokachi a alors de gros problèmes de genou. Sa carrière se termine en 1999 lorsqu'il quitte Beşiktaş. Un contrat qu'il signe avec Munich 1860 est en effet annulé après des tests médicaux.
En parallèle à ces activités, il était adjoint de Berti Vogts sélectionneur des Super Eagles de janvier à avril 2007. Il a démissionné après des divergences de points de vue et de méthodes avec l'Allemand. Il est de retour dans le staff de l'équipe du Nigéria en 2008, comme adjoint de Shaibu Amodu. Il devient entraîneur principal par intérim en 2014-2015.
En 2016 il tente sa chance en Europe, en Finlande avec le JS Hercules (deuxième division) à Oulu.