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On sait peu de choses de ce codex. On ignore comment il est parvenu jusqu’en Europe mais son âge est estimé à 600 ans au moins. Certains chercheurs pensent qu’il est d'origine mixtèque ou tlaxcaltèque, car le style pictographique correspond à celui de ces peuples.
Le nom originel de ce codex n’est pas parvenu jusqu’à nous.
Conservation
Comme d'autres codex mésoaméricains, il a été nommé en fonction de son plus ancien propriétaire et conservateur connu, le cardinal Stefano Borgia, qui est entré en possession de ce codex après que ce dernier a été découvert au Mexique au XVIe siècle, puis expédié vers l'Espagne et enfin l'Italie. On raconte[Qui ?] qu'un jour, le cardinal Borgia visitait le palais d'un de ses amis ; passant devant une cheminée dans laquelle un groupe d'enfants jetait aux flammes un livre couvert de dessins, il récupéra in extremis le codex, sauvant ainsi ce précieux document.[réf. nécessaire]
Le codex Borgia est un tonalamatl, un « Livre du Destin », qui permettait aux devins d'interpréter les influences propices ou néfastes des dieux pour chaque jour de l'année. Ces devins étaient appelés « tonalpouhque », que l’on pourrait traduire par « ceux qui tiennent les comptes des jours » ou bien « ceux qui savent lire le destin ». Ils consultaient ce calendrier divinatoire pour réaliser toute sorte de prophéties : savoir quel était le jour le plus propice pour réaliser des voyages, faire la guerre, se marier, entreprendre les travaux des champs mais surtout prédire le « tonalli », c’est-à-dire le destin des nouveau-nés.
En effet, le jour de la naissance était si important que le nom des enfants correspondait à un jour du calendrier. On naissait par exemple le jour un crocodile, cinq vent ou dix roseau, on était placé sous l'influence du dieu de l'eau, du soleil levant ou du jaguar nocturne. Chaque jour correspondait à un destin particulier, et chaque jour influençait un trait de caractère précis de la personnalité.
(en) Maarten Jansen, « Borgia, Codex », dans The Oxford encyclopedia of Mesoamerican cultures: The civilizations of Mexico and Central America, vol. 1, Oxford University Press, (ISBN0-19-514255-1, OCLC44019111), p. 94–98.