Fils aîné d'Étienne Báthory (1477-1534), voïvode de Transylvanie de 1530 à sa mort et de Catherine Telegdi, il naît en 1530 à Szilágysomlyó, dans le comitat de Szilágy.
Il remplace en 1576 son frère cadet Étienne comme voïvode de Transylvanie, lorsque ce dernier est élu roi de Pologne. Il s'allie avec les Ottomans et gouverne jusqu'à sa mort, le 27 mai 1581, à Gyulafehérvár.
