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À partir de 2003, Christophe Badoux enseigne au département d'art et de design de la Haute école de Lucerne (Suisse).
En 2008, en collaboration avec le centre Paul Klee de Berne, les éditions Moderne ont publié sa bande dessinée Klee qui traite la vie du peintre suisse Paul Klee dans le contexte des événements historiques de 1879 à 1940.
En janvier 2010, les Éditions Castagniééé ont publié sa bande dessinée La Cinquième Variable, une satire du conflit intergénérationnel et du système des caisses de pensions en Suisse. À partir d'avril 2010, et en collaboration avec Marcel Gamma, il publie également des bandes dessinées en ligne, Stan the Hooligan, consacrées au supporter du club de football FC Zurich.
Marié avec la chanteuse de rock zurichoise Nadja Zela, dont il a deux enfants, Christophe Badoux a vécu et travaillé à Zurich.
