De son côté, l'Église catholique en Érythrée a des diocèses à Asmara, à Barentu et à Keren. Elle regroupe 150 000 fidèles, répartis en trois éparchies.
On compte aussi environ 90 000 protestants luthériens en Érythrée.
Depuis 2002 les seules églises reconnues par l'État sont l'église luthérienne, l'Église catholique romaine et l'Église érythréenne orthodoxe. L'Église Adventiste du Septième Jour est en particulier interdite.