Charles Henry fit ses études à Paris, où il devint assistant en 1881 puis bibliothécaire, à la Sorbonne. Il fut envoyé en Italie, comme spécialiste de l'histoire des mathématiques, pour chercher dans ce domaine des manuscrits que le gouvernement souhaitait éditer. Il publia plusieurs travaux sur des sujets analogues, ainsi que des mémoires, des lettres et d'autres ouvrages, et écrivit des critiques sur les théories musicales de Rameau et Wronski. On lui attribue aussi l'invention de plusieurs dispositifs et instruments ingénieux utilisés dans les laboratoires de psychophysiologie. Il publia la correspondance de Pierre-Daniel Huet sous le titre Un érudit, homme du monde, homme d'église, homme de cour (1880), ainsi que Problèmes de géométrie pratique (1884) et Lettres inédites de Mademoiselle de Lespinasse à Condorcet, à D'Alembert, à Guibert, au Comte de Crillon (1887).
Sélection de publications
Introduction à une esthétique scientifique, Paris, 1885
La théorie de Rameau sur la musique, Paris, Hermann, 1887
Wronski et l'esthétique musicale, Paris, Hermann, 1887
