Après avoir été professeur de zoologie à l'université de Caen, il devient en 1967 titulaire de la chaire d'évolution des êtres organisés à l'université de Paris, succédant à Pierre-Paul Grassé[5].
Il décède en 1977[5], ce grand fumeur fut terrassé par la maladie et ne put achever son deuxième mandat. Il dirigea durant quelques années le laboratoire de génétique évolutive de Gif-sur-Yvette (s'intéressant alors à la génétique des drosophiles) et la Station biologique des Eyzies. Il fut l'un des co-directeurs et co-auteurs de la série d'ouvrages sur les problèmes de l'espèce dans le règne animal, éditée par la Société zoologique de France, à laquelle il était profondément attaché. Il fut aussi le rédacteur en chef des Archives de zoologie expérimentale et générale.
Charles Bocquet est crédité comme le créateur d'une nouvelle discipline scientifique, la "systématique évolutive"[5].
Prix Charles Bocquet
La Société zoologique de France attribue tous les trois ans depuis 1979 le Prix Charles Bocquet qui récompense les chercheurs en biologie de l'évolution, prix créé par sa femme Jacqueline Bocquet à la mémoire de son mari[5].
