Localisation des équipes issues de la partie orientale de la Russie.
La saison 2016-2017 de FNL est la vingt-cinquième édition de la deuxième division russe. C'est la sixième édition à suivre un calendrier « automne-printemps » à cheval sur deux années civiles. Elle prend place du au .
Vingt clubs du pays sont regroupés au sein d'une poule unique où ils s'affrontent à deux reprises, à domicile et à l'extérieur. En fin de saison, les cinq derniers du classement sont relégués en troisième division tandis que les deux premiers sont directement promus en première division, alors que le troisième et le quatrième doivent disputer un barrage de promotion face au treizième et au quatorzième du premier échelon.
Le Dynamo Moscou remporte la compétition et retourne en première division une année après l'avoir quittée. Il est accompagné de son dauphin le FK Tosno et du SKA-Khabarovsk, quatrième et vainqueur du barrage de promotion face au FK Orenbourg. Le troisième, le Ienisseï Krasnoïarsk, échoue quant à lui face à l'Arsenal Toula.
Le joueur du Dynamo Moscou Kirill Pantchenko termine meilleur buteur de la compétition avec vingt-quatre buts inscrits, suivi de Khasan Mamtov du FK Tioumen qui en a inscrit vingt-trois et d'Anton Zabolotny du FK Tosno qui en comptabilise seize. Danil Klionkine du FK Tioumen finit quant à lui meilleur passeur du championnat avec douze passes décisives délivrées sur l'ensemble de la saison.
Parmi ces clubs, le SKA-Khabarovsk est celui présent depuis le plus longtemps avec une participation ininterrompue en deuxième division depuis 2002, suivi du Baltika Kaliningrad présent depuis 2006 et du Chinnik Iaroslavl prenant part à la compétition depuis 2009.
La pré-saison est marquée par les repêchages du Ienisseï Krasnoïarsk et du Baltika Kaliningrad, relégables en fin de saison dernière, qui profitent de la non-promotion du Smena Komsomolsk-sur-l'Amour, vainqueur du groupe Est de la troisième division[1], et de la disparition du Volga Nijni Novgorod, dixième la saison précédente[2].
Le classement est établi sur le barème classique de points (victoire à 3 points, match nul à 1, défaite à 0). Pour départager les équipes à égalité de points, on utilise les critères suivants[3] :
Nombre de matchs gagnés
Confrontations directes (points, matchs gagnés, différence de buts, buts marqués, buts marqués à l'extérieur)
Confronté à l'Arsenal Toula, le Ienisseï remporte dans un premier temps le match aller à domicile sur le score de 2-1 avant d'être vaincu à l'issue du match retour à Toula sur le score de 1-0, étant éliminé par la règle des buts marqués à l'extérieur. L'Arsenal se maintient ainsi en première division au détriment du Ienisseï. Les deux rencontres opposant le SKA et le FK Orenbourg donnent quant à eux lieu à deux matchs nuls 0-0 et les deux équipes doivent se départager aux tirs au but à l'issue du match retour à Orenbourg. L'équipe de deuxième division l'emporte finalement sur le score de 4-3 et est promu en première division pour la saison 2017-2018 au détriment d'Orenbourg qui est relégué.
Le tableau suivant récapitule le classement au terme de chacune des journées définies par le calendrier officiel, les matchs joués en retard sont pris en compte la journée suivante.