Le colonel Pascot, arrivé au poste de commissaire aux sports de Vichy un an plus tôt, ordonne que les 32 clubs professionnels soient remplacés par 16 équipes fédérales pour la saison 1943-1944. Les clubs dépossédés de leurs sections professionnelles poursuivent leurs activités footballistiques, s'ils le veulent, dans le championnat de France amateurs. Ils sont toujours autorisés à participer à la Coupe de France, tout comme les nouvelles équipes fédérales.
Les équipes sont réparties en 12 groupes géographiques[1]. Les groupes A, B, C, D, E, F, G, H, I, J, K et L représentent respectivement les zones de Flandres, d'Île-de-France, de Provence, du Languedoc, de Normandie, de la Champagne-Lorraine, de la Bourgogne-Franche-Comté, de la Bretagne-Anjou, d'Orléanais-Poitou, du Limousin-Auvergne, du Lyonnais-Dauphiné et de la Guyenne-Pyrénées. Les vainqueurs des groupes sont qualifiés pour la phase finale[2].
Le groupe A de la Flandre et le groupe B de la région parisienne sont divisés en deux petites poules. Un match de barrage est organisé entre les deux équipes arrivées en tête de leurs poules pour déterminer le club qualifié pour la phase finale.
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