Le nom du genre Brontomerus, qui dérive du grec ancienβροντή, brontê, « tonnerre », et μήρος, méros, « cuisse », fait référence à sa musculature fémorale[1].
Son épithète spécifique, mcintoshi, lui a été donnée en l'honneur de John S. McIntosh(d) (1923-2015), physicien et paléontologue américain, et ce en reconnaissance de ce vétéran qui, la plupart du temps sans financement et à son propre rythme, a été une inspiration pour tous ceux qui l'ont suivi dans l'étude des sauropodes[1].