Il dispute son premier test match le contre les All Blacks dans une série qui est remportée par les Springboks avec deux victoires, un match nul et une défaite[1]. Il est nommé capitaine lors de sa troisième sélection pour sept matchs consécutifs.
En 1960-1961 il est sélectionné à cinq reprises avec les Springboks, qui font une tournée en Europe. Il l'emporte sur le pays de Galles 3-0. Il participe ensuite à la victoire contre l'Irlande 8-3 puis à celle sur l'Angleterre 5-0 et enfin l'Écosse 12-5.
Le les Sud-africains concèdent le match nul à Paris 0-0.
Avril Malan joue contre les Lions britanniques un seul des quatre matchs de la tournée de 1962. Il joue trois matchs comme deuxième ligne contre les Wallabies en tournée en Afrique du Sud en 1963 (dont un comme capitaine), il participe en 1964 à la victoire sur le pays de Galles 24-3.
Il est retenu en 1965 pour disputer deux matchs contre l'Irlande et l'Écosse, ce sont ses dernières rencontres internationales[1].
Il effectue sa carrière en club au sein de la province du Transvaal.