Vita Justi Lipsii, Anvers, 1609 (un obituaire de Justus Lipsius, l'un de ses professeurs à Louvain), dédicacé à Jan Andrzej Próchnicki (1553–1633), évêque de Kamianets-Podilskyi 1607-1614 (voir dans Google books);
Rerum toto orbe gestarum chronica a Christo nato ad haec usque tempora, Anvers, 1608 (contenant les chroniques d'Eusebius, Saint Jérôme, Sigebert de Gembloux, Anselme de Gembloux, et d'autres allant jusqu'à l'an 1200, et la suite de ces chroniques réalisées par Miraeus jusqu'en 1608) (voir dans Google books);
Equitum redemptoris Jesu Christi ordo, Anvers, 1608 (sur la fondation de l'Ordre de la Rédemption ou Ordre militaire du Sang de Jésus Christ), dédicacé à Vincenzo Gonzaga (voir dans Google books);
Origines equestrium sive militarium ordinum libri duo, Anvers, 1609 (un volume sur les origines d'ordres militaires) (voir dans Google books);
même ouvrage publié en français : Origine des chevaliers et ordres militaires, Anvers, 1609, dédicacé à Gaston Spinola, comte de Bruay (voir dans Google books);
Politia ecclesiastica, sive de statu religionis Christianae per totum orbem, Cologne, 1609; Lyon 1620 (voir dans Google books)
La cathédrale Notre-Dame d'Anvers
Ordinis carmelitani, ab Elia propheta primum incohati, ab Alberto patriarcha Ierusolymitano vitae regula temperati, a B. Teresia virgine Hispana ad primaevam disciplinam revocati, origo atque incrementa, Anvers, 1610 (sur l'origine et l'histoire de l'Ordre du Carmel), dédicacé à Isabelle-Claire-Eugénie d'Autriche (voir dans Google books);
Geographia ecclesiastica, Lyon, 1620 (Une liste alphabétique de diocèses catholiques à travers le monde), dédicacé à Gaspard de Mornieu (voir dans Google books);
" Sanctorum Galliae Belgicae imagines et elogia quibus religionis ortus progressusque in Belgio ostenditur". Antverpiae, apud Th. Gallaeum. 1620. Petit in-4°. Titre gravé, et 53 figures, avec brève biographie gravée en bas des planches;
Notitia ecclesiarum Belgii, Anvers, 1630, dédicacé à Philippe IV d'Espagne (voir dans Google books); (Cet ouvrage, comme d'autres travaux de Miraeus sur l'histoire ecclésiastique des Pays-Bas, a été réédité par Johannes Franciscus Foppens, sous le titre de Miraei opera diplomatica et Historica, 4 vols., Bruxelles, 1723–48);
De congregationibus clericorum in communi viventium, Cologne, 1632 (une histoire des origines des congrégations de Clercs réguliers, comme les Théatins, les Jésuites, les Barnabites, les Oratoriens, etc.), dédicacé à Nicolaus Albertus de Oleksow Gniewosz, envoyé de la cour de l'Infante Isabelle et plus tard, évêque de Cujavie (voir dans Google books);
Rerum Belgicarum chronicon, Anvers, 1635 (Une chronique de l'histoire des Pays-Bas de -58 à 1635), dédicacé au Cardinal-Infante Ferdinand (voir dans Google books).
Diplomatie
Elogia Belgica sive illustrium Belgii scriptorum, Anvers, 1609, dédicacée au conseil communal d'Anvers (voir dans Google books);
Elenchus historicorum et aliorum scriptorum, nondum typis editorum, qui in Belgicis potissimum bibliothecis manuscripti exstant, Bruxelles, 1622 (une liste manuscrite d'auteurs diffusés en librairies) - (voir dans Google books);
Codex donationum piarum, Bruxelles, 1624 (une anthologie de dotations médiévales), dédicacé à Petrus Peckius (voir dans Google books);
Donationum Belgicarum libri II, Anvers, 1629 (une anthologie de dotations médiévales), dédicacé à Ferdinand de Boisschot, baron de Zaventem (voir dans Google books);
Bibliotheca ecclesiastica, 2 vols, Anvers, 1639-1649 (une compilation de courts passages sur les écrivains ecclésiastiques écrite par saint Jérôme, Gennade, Saint-Isidore, Saint-Ildefonse, Honorius Augustodunensis, Sigebert de Gembloux et Henri de Gand, complété de notes par Miraeus).
Lettres
Certaines de ses lettres ont été publiées par Burbure in Messager des Sciences Historiques de Belgique (1859).
C.-B. De Ridder, Aubert Le Mire, sa vie, ses écrits: mémoire historique et critique. Mémoires couronnés et mémoires des savants étrangers, publiés par l’Académie royale des sciences, des lettres et des beaux-arts de Belgique, 31; Brussels: Hayez, 1863, consultable sur le site Persée.
