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Le , la Lune est détruite a 70 %. Une créature étrange menace de faire subir la Terre le même sort en . Quasi invulnérable, il se déplace à Mach 20 et possède des tentacules. Avant de mettre sa menace à exécution, il fait une offre au gouvernement japonais. Il devient professeur de la classe 3-E, la classe des cancres du collège Kunugigaoka, à laquelle il doit enseigner à devenir des assassins. Le gouvernement japonais offre une récompense de dix milliards de yens à celui qui tuerait cette créature, et fait venir des tueurs professionnels dans la classe.