Il a développé le concept de dehydron[4],[5] un défaut structurel adhésif dans une protéine soluble qui favorise sa propre déshydratation[6].
Un dehydron se compose d'une liaison hydrogène intramoléculaire qui est underwrapped ou incomplètement protégée contre l'attaque par l'eau dans la couche d'hydratation des protéines[4]. Les dehydrons créent une tension épistructurelle, qui est la tension interfaciale autour de la structure des protéines[6], et favorisent donc les interactions protéine-protéine et les associations protéine-ligand[4],[7]. La nature non conservée des protéines dehydrons a des implications dans la découverte de médicaments, car les dehydrons peuvent être ciblés par des médicaments très spécifiques conçus pour améliorer l'« emballage » (wrapping) des dehydrons lors de la liaison[8]. Ainsi, les dehydrons constituent des filtres de sélectivité efficaces pour la conception de médicaments, ce qui donne lieu à ce qu'on appelle la « technologie d'emballage », une plateforme permettant de concevoir des médicaments plus sûrs[9],[10],[11]. Dans une application récente de la technologie d'emballage, les régions riches en dehydrons dans une protéine spécifique ont été ciblées par Richard L. Moss et Ariel Fernandez afin de concevoir des pistes de médicaments pour guérir l'insuffisance cardiaque (US patent no 9, 051, 387)[12].
Ariel Fernandez a publié sept livres et plus de 450 articles revus par des pairs[13]. Il est aussi un inventeur principal dans deux brevets en biotechnologie (US patents 8466154 and 9051387)[14],[15].
Prix
Fernandez a reçu la Médaille d'État de Buenos Aires (1980)[1], le prix Camille and Henry Dreyfus Teacher-Scholar en 1991[16], une bourse Guggenheim en 1995[17], le prix Humboldt (1995) et est un membre élu de l'American Institute for Medical and Biological Engineering (2006) [18].
Publications
Transformative Concepts for Drug Design: Target Wrapping, Springer-Verlag, Berlin, Heidelberg, 2010 (ISBN978-3642117916)
↑ ab et cS. Koppes, Discovery of new sticky force that binds proteins could lead to better drug design, 2 juillet 2003 dehydron
↑A. Fernández, R. Scott, Dehydron: a structurally encoded signal for protein interaction, Biophys J, 2003 Sep;85(3):1914-28. PMID12944304[1]
↑ a et bA. Fernández, R. Scott, Adherence of packing defects in soluble proteins, Phys Rev Lett, 2003 91(1):018102. PMID12906578[2]
↑D. Monroe, Focus: Proteins Hook up Where Water Allows, Physics, 4 mai 2012 ; 5, 51 [3]
↑S. Crunkhorn, Anticancer drugs: Redesigning kinase inhibitors, février 2008, Nature Revs Drug Discovery, 7:120-121 doi 10.1038/nrd2524 [4]
↑J. Boyd, Drug design: New book introduces fresh approach, 28 avril 2010 [5]
↑G. D. Demetri, Structural reengineering of imatinib to decrease cardiac risk in cancer therapy, 3 décembre 2007, J Clin Invest, 117(12):3650–3653. doi 10.1172/JCI34252 [6]
↑Wisconsin Alumni Research Foundation, Invention: Treating Heart Failure by Inhibiting Myosin Interaction with a Regulatory Myosin Binding Protein (US patent no 9051387), Inventors: Richard L. Moss and Ariel Fernandez [8]