Il fait ses débuts avec les Rangers durant les séries éliminatoires de la Coupe Stanley en 1991. Au cours de la saison 1991-1992, en tant que débutant, il laisse déjà une forte impression, en marquant 35 buts et en se plaçant troisième dans le classement pour l'obtention du Trophée Calder.
Il joue trois saisons pour les Rangers, marquant 84 buts au total, avant d'être échangé aux Blackhawks de Chicago durant la saison 1993-1994, l'année où les Rangers remportent la Coupe (Amonte ne joue que sept matchs pour les Blackhawks de Chicago cette même saison).
Durant ses huit saisons à Chicago, il acquit une solide réputation, marquant chaque saison une trentaine ou une quarantaine de buts.
Néanmoins, Tony Amonte décide de rejoindre l'équipe des Coyotes de Phoenix au début de la saison 2002-2003. Ce passage est de courte durée, car il est échangé aux Flyers de Philadelphie peu avant la fin de la saison.
Le , il signe un contrat en tant qu'agent libre avec les Flames de Calgary pour la saison 2005-2006. Le , il marque son 400e but en LNH dans un match opposant les Flames de Calgary aux Sénateurs d'Ottawa.