Elle s'inscrit en tant qu'avocate à l'ordre néerlandophone du Barreau de Bruxelles et à la Chambre de commerce d'Anvers. En 2002, elle est engagée comme avocate chez DLA Piper, un cabinet d'avocats d'origine américano-britannique, où elle est également devenue chef du département belge[1]. Lorsque le dossier Arco a été porté devant le Conseil d'État et la Cour européenne de justice, elle agit en tant que défenderesse de l'État belge[2].
Annelies Verlinden est chef de groupe chez VKSJ Schoten et, entre 2005 et 2009, elle est vice-présidente des jeunes CD&V. Entre 2003 et 2012, elle est également conseillère communale à Schoten. En 2004, elle participe aux élections régionales, où elle est à la neuvième place sur la liste du cartel CD&V/N-VA pour la Région flamande[1]. Elle n'est pas élue.
Le , elle est nommée ministre de l'Intérieur du gouvernement De Croo, sans avoir jamais été élue dans un parlement[3].