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Moguilov fait des études de physique puis enseigne la physique. En 1982, il change de profession pour travailler dans la police criminelle au ministère de l'Intérieur. Onze ans plus tard, en 1993 (après la chute de l'URSS), il est diplômé de l'école supérieure du ministère de l'Intérieur ukrainien. Il est longtemps en poste à Makiïvka dans l'oblast de Donetsk. En 2007, il dirige la police de la république autonome de Crimée avec le rang de général-major. Il est favorable à la candidature de Viktor Ianoukovytch à la présidentielle de 2010, bien que sa fonction impose théoriquement la neutralité[1]. Il s'est fait connaître par ses positions hostiles et ouvertement racistes aux Tatars de Crimée[2]. Il est suspendu le , au début de la crise de Crimée, et contraint à démissionner avec son cabinet. Il est remplacé par le pro-russe Sergueï Aksionov, qui appelle à un référendum le suivant sur le statut de la Crimée au sein de l'Ukraine ou sur un rattachement à la Russie[3]. Moguilov se réfugie alors dans la capitale Kiev[4].