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La faible résolution de l'artwork de couverture est intentionnelle, de sorte que l'EP ressemble à un enregistrement bootleg. L'arrière de la pochette comporte une grille de jeu de mots cachés dont les lettres, une fois découvertes, délivrent des détails de l'enregistrement[6].
Classement et nominations
Malgré une promotion relativement faible, Amoeba's Secret atteint la 119e place du classement américain des albums Billboard 200[7].
Deux des titres de cet EP sont nominés lors de la 51e cérémonie des Grammy Awards (2008) qui s'est déroulée le au Staples Center à Los Angeles, That Was Me pour la « meilleure performance vocale pop masculine » et I Saw Her Standing There pour la « meilleure performance vocale rock solo »[8]. Cependant, aucune de ces chansons ne gagne, s'inclinant devant celles de John Mayer (respectivement Say et Gravity)[9]. Durant la cérémonie, McCartney interprète I Saw Her Standing There accompagné de Dave Grohl à la batterie.
Le , le site web de Paul McCartney publie une version étendue de la prestation à l'Amoeba intitulée Live in Los Angeles - The Extended Set, elle est gratuite pour les membres "premium" du site et bénéficie de 2 titres supplémentaires par rapport à l'édition précédente de 2010[11].
Le , le concert complet sera publié sur l'album Amoeba Gig[12].
