Il commence l'année avec l'espérance de faire mieux que la saison précédente, travaillant dur en avant-saison sous les ordres de Rodrigo Pacheco, son directeur sportif. Le relief accidenté de la course en ligne des championnats 2016 lui plaisant, il se voit lutter pour une médaille. Bien plus que la Vuelta al Tolima, qu'elle dispute en "régional de l'étape", le défi numéro un de son équipe est le Tour de Colombie (à l'égal du Clásico RCN). Serna y a pour objectif de monter sur le podium. Bon grimpeur, les contre-la-montre en côte ne lui posent pas de problème au contraire de ceux en plaine, où il doit s'améliorer[1]. En fait de podium, Alejandro Serna termine vingtième du championnat national, à plus de trois minutes de la médaille de bronze[2].
2018
En 2019, après plusieurs cas de dopage détectés en Colombie au cours de cette année, la Fédération colombienne de cyclisme publie une liste des cyclistes sanctionnés par cette organisation depuis 2010. Parmi ces noms figure Alejandro Serna, suspendu pour une durée de quatre ans à partir du , pour un passeport biologique anormal[3].
