En 1999, Aimé Ngoy Mukena est nommé PDG de la Régie des voies aériennes par le président Laurent Désiré Kabila. De 2001 et 2004, il exerce la fonction de gouverneur de la province du Katanga[5]. Il est ensuite député à l'Assemblée nationale de 2006 à 2012 et de 2019 à 2022. En , Il est nommé membre du conseil d'administration de la Société nationale des chemins de fer du Congo[6]. Le , il est nommé ministre de la Défense nationale et des Anciens combattants dans le gouvernement Matata II[7]. Après un remaniement en 2015, il est ministre des Hydrocarbures dans les gouvernements Tshibala, Badibanga et Matata II, poste qu'il conserve jusqu'en septembre 2019, quand il est nommé une nouvelle fois ministre de la Défense nationale et des Anciens combattants, fonction qu'il occupe jusqu'en avril 2021.
La dimension politique et économique de la « Révolution de la modernité » dans Frontières et gouvernance sécuritaire pour le développement économique de la République démocratique du Congo, L'Harmattan, 2013[2].
Parcours de l'histoire de la philosophie négro-africaine : à l'usage des étudiants de deuxième graduat en philosophie[9]
Tout arrive à tous et autre nouvelles, Lubumbashi, Éditions Pensées du sud, [2002][10]
La critique du sens de l'Homme dans l'économisme occidental totalitaire au départ de la pensée de L.S. Senghor, 2000[11]
Monseigneur Fariala, ou, Le salaire du péché : (drame en cinq tableaux), 2002[12]
Première épître aux enfants de mon village : sur le double événement du mois de mai, 2004[13]
Ma vision du Katanga : un nouveau regard sur une cité natale à rebâtir[14]
L'hégémonie du peuple et la fin des idéologies de domination : dialogues sur la Cité, 2000[15]
Jean-Marie Dikanga Kazadi et Emmanuel Banywesize, Frontières et gouvernance sécuritaire pour le développement économique de la République démocratique du Congo, L'Harmattan, (ISBN978-2-336-29761-3, présentation en ligne)
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