L'organisation est fondée en décembre 1970 au Caire[2]
Depuis 1974, l'organisation organise notamment les championnats d'Afrique de natation qui ont lieu tous les deux ans les années paires depuis 2002.
Zones et membres
La CANA répartit ses membres en quatre zones[3] à l'intérieur desquelles sont organisées des compétitions régionales. Les zones et leurs pays membres sont définies dans la constitution de la CANA[4].